CAMBRIDGE, Inglaterra, 19 de julio de 2022 (Newswire.com) –
RxCelerate, una plataforma líder internacional de descubrimiento y desarrollo de fármacos subcontratados, reveló hoy los detalles de una nueva plataforma de descubrimiento de moléculas pequeñas, RxNfinity™, que aprovecha el aprendizaje automático, el modelado de estructuras in silico y la química combinatoria en un flujo de trabajo novedoso que ofrece ventajas significativas sobre la generación actual. de herramientas para identificar fármacos de molécula pequeña frente a una amplia gama de dianas proteicas.
«Hoy estamos lanzando una tecnología de descubrimiento de moléculas pequeñas que va un paso más allá de todo lo que está disponible para nuestros competidores, incluidas las compañías farmacéuticas más grandes», dijo Jill Reckless, directora ejecutiva de RxCelerate. «De la misma manera que nuestra plataforma de descubrimiento de anticuerpos Galaxy™ llevó el proceso de descubrimiento de nuevas terapias de anticuerpos a un nuevo nivel, RxNfinity™ representa un nuevo vértice en velocidad y eficiencia en el descubrimiento de fármacos de moléculas pequeñas».
RxNfinity™ es una creación del químico estrella del descubrimiento in silico Jon Heal, vicepresidente ejecutivo de ProsaRx, la unidad computacional de descubrimiento de fármacos en RxCelerate. Después de casi dos años de arduo trabajo y una gran inversión en una nueva infraestructura computacional, Heal ha logrado un cambio radical en la calidad de los resultados que puede brindar. «El problema con todas las bibliotecas espaciales químicas existentes», explica Heal, «es la gran diversidad de moléculas posibles: hay más moléculas pequeñas tratables sintéticamente que átomos en el universo. Incluso la más grande, como la biblioteca Merck MASSIV, tiene ‘ solo’ 1020 moléculas en él, representando una gota en el océano en comparación con todas las moléculas posibles. Como resultado, identificar aciertos iniciales de alta calidad contra un objetivo determinado es un desafío, especialmente porque estos grandes espacios solo se buscan mediante similitudes 2D o métodos relacionados que requieren el conocimiento de los compuestos activos existentes antes de comenzar. Para un objetivo novedoso, ¿cómo se empieza?»
RxNfinity™, por el contrario, mueve los postes de la portería no aumentando el tamaño de la biblioteca (aunque es tan grande como cualquier espacio químico), sino enriqueciendo su composición para posibles aciertos. «A medida que aumenta el tamaño de la biblioteca, también lo hace el desafío computacional», dice Heal, «por lo que mejorar el resultado por pura fuerza bruta pronto se vuelve intratable. Así que recurrimos a la tecnología emergente de aprendizaje automático para hacer que nuestro espacio químico sea más inteligente en lugar de solo más grande .»
RxNfinity™ adapta el enfoque de «sintón virtual» descrito por primera vez por Sadybekov y sus colegas en la revista científica líder Naturaleza en diciembre de 2021 (Naturaleza volumen 601, páginas 452-459 (2022)). «En efecto, la biblioteca se construye en el sitio activo de su objetivo», dice Nigel Ramsden, vicepresidente ejecutivo de RxChemistry, quien dirige el grupo de química médica en RxCelerate. «Cada bloque de construcción, a su vez, se evalúa para determinar la calidad del ajuste frente al objetivo de la proteína, antes de incorporarse a la biblioteca en crecimiento, adaptando así el espacio químico final a su objetivo. Es conceptualmente simple, pero el impacto es transformador».
El resultado de la fase computacional es una colección de moléculas parecidas a fármacos manejables sintéticamente que pueden fabricarse y probarse fácilmente. Todo el proceso, desde la nominación del objetivo hasta el éxito verificado experimentalmente, lleva unas seis semanas. Igualmente importante, en tiempos de inestabilidad geopolítica, todo el trabajo experimental se puede completar en el Reino Unido utilizando productos químicos de origen local, lo que garantiza que los servicios de RxNfinity™ nunca se interrumpan.
«La diferenciación clave para RxNfinity™ es que el espacio químico es dinámico, ensamblado de novo cada vez, incorporando de manera única la estructura del objetivo en particular y usando solo química tratable. Esto garantiza que la capacidad de la biblioteca disponible se llene con mejores candidatos, lo que se traduce en una mayor probabilidad de ofrecer perfiles farmacológicos más complejos junto con propiedades similares a las de los fármacos», explicó Ramsden.
Además de diseñar e implementar los flujos de trabajo basados en IA, RxCelerate ha realizado una gran inversión en una infraestructura informática de última generación para ejecutar el modelado. «También estamos encantados de haber firmado un acuerdo con la Universidad de Newcastle para acceder al servicio ROCKET HPC, así como a los recursos escalables de computación en la nube», dijo Heal, «que garantiza el acceso a la potencia de procesamiento intensiva necesaria para ofrecer RxNfinity™ a escala».
«Este nuevo concepto de espacios químicos dinámicos es transformador», dijo David Grainger, presidente ejecutivo de RxCelerate. «La capacidad de generar bibliotecas personalizadas tratables sobre la marcha para cada objetivo ofrece mejores aciertos que incluso los espacios estáticos más grandes. Mejor aún, nuestra visión es hacer que las mejores tecnologías estén disponibles para todos sobre la base de una tarifa por servicio, lo que permite cualquiera que tenga una buena idea para llevarla a la práctica. Con RxNfinity™, el descubrimiento de moléculas pequeñas ahora es más fácil».
Notas para editores
Acerca de RxCelerate
RxCelerate es una empresa subcontratada de descubrimiento y desarrollo de fármacos, fundada en Cambridge, Reino Unido, en 2013, con un enfoque en el trabajo más inteligente. Ha crecido rápidamente hasta convertirse en uno de los principales proveedores de servicios de desarrollo de fármacos en el Reino Unido. RxCelerate opera un modelo único, brindando capacidades para descubrir y desarrollar medicamentos para los clientes, diseñando y ejecutando todos los aspectos del plan de investigación y desarrollo.
RxCelerate ofrece una amplia gama de servicios. El equipo de biología se especializa en farmacología in vivo y ofrece modelos patentados de una amplia gama de enfermedades humanas, así como ensayos complejos basados en células. El equipo de química proporciona química médica, incluida la detección in silico y la síntesis que se integra a la perfección con la capacidad de prueba in vitro. Un equipo dedicado diseña la estrategia óptima de descubrimiento o desarrollo para cada proyecto, así como la gestión integrada del programa. Al trabajar en estrecha colaboración, estos equipos pueden ofrecer candidatos a productos farmacéuticos de grado farmacéutico a una fracción del costo de los enfoques tradicionales.
RxCelerate cuenta con un equipo de más de 60 empleados y consultores ubicados en 25 000 pies cuadrados de espacio de oficina y laboratorio de primer nivel en el edificio Dorothy Hodgkin en el campus de investigación de Babraham, aproximadamente cinco millas al sur de Cambridge, Reino Unido, así como oficinas en Boston, MA y San Francisco, CA.
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Fuente: RxCelerate
